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相反的，从低能级轨域到高能级轨域则会吸收能量。藉著这些化轨域，玻尔正确地计算出氢原子光谱。但是，使用玻尔模型，并不能够解释谱线的相对强度，也无法计算出更复杂原子的光谱。这些难题，尚待后来力学的解释。

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于1924年，奥地利物理学家沃尔夫冈·泡利用一组参数来解释原子的壳层结构。这一组的四个参数，决定了电子的态。每一个态只能容许一个电子占有。（这禁止多于一个电子占有同样的态的规则，称为泡利不相容原理）。这一组参数的个参数分别为主数、角数和磁数。

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电子显微镜主要分为两种类式：穿透式和扫描式。穿透式电子显微镜的操作原理类似高架式投影机，将电子束对准于样品切片发射，穿透过的电子再用透镜投影于底片或电荷耦合元件。扫描电子显微镜用聚焦的电子束扫描过样品